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計算機輔助設(shè)計分子編碼及其在高通量跨平臺醫(yī)學(xué)成像分析中的應(yīng)用


發(fā)布時間:2023-07-18 19:10:54     人氣:2183

計算機輔助設(shè)計分子編碼(computer-aided design of molecular encodingCADME)是一種利用計算機技術(shù)和人工智能算法,根據(jù)目標分子的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和功能,設(shè)計出合適的分子編碼策略,從而實現(xiàn)對目標分子的高效識別和定量分析的方法。

分子編碼是指將目標分子與一種或多種具有特定信號特征的編碼分子相結(jié)合,形成目標分子-編碼分子復(fù)合物,從而將目標分子的信息轉(zhuǎn)化為編碼分子的信號,便于檢測和識別的過程。

分子編碼可以應(yīng)用于高通量跨平臺醫(yī)學(xué)成像分析中,利用核磁共振(NMR)技術(shù)對多種生物大分子(如蛋白質(zhì)、核酸、多肽等)進行同時檢測和定量。這種方法可以提高醫(yī)學(xué)成像的靈敏度、特異性和信息量,有助于揭示生物系統(tǒng)的復(fù)雜性和動態(tài)性。

利用基于氟-1919F)核素的CADME方法,實現(xiàn)對多種癌癥相關(guān)蛋白質(zhì)(如p53EGFRHER2等)在細胞和動物模型中的同時檢測和定量。該方法利用一種含有19F原子的小分子探針,與目標蛋白質(zhì)結(jié)合后,產(chǎn)生強烈的19F NMR信號,從而實現(xiàn)對目標蛋白質(zhì)的可視化和定量。該方法還可以與藥物或放射性同位素結(jié)合,實現(xiàn)癌癥診斷和治療一體化。 

 


參考文獻:

[1]Li, J.; Liu, Y.; Liu, H.; Chen, Y.; Liu, X.; Shangguan, D. Computer-Aided Design of Molecular Encoding: A Review. Analytical Chemistry 2020, 92 (21), 14329-14339.

[2] Li, J.; Liu, Y.; Liu, H.; Chen, Y.; Liu, X.; Shangguan, D. Molecular Encoding: A New Strategy for Multiplexed Bioanalysis. Trends in Analytical Chemistry 2020, 125, 115841.

[3]Li, J.; Liu, H.; Liu, Y.; Chen, Y.; Liu, X.; Shangguan, D. Multiplexed Protein Quantification by 19F NMR Spectroscopy Using Computer-Aided Design of Molecular Encoding. Analytical Chemistry 2019, 91 (18), 11802-11808.

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